Here are all the tools I have developed during the projects I have participated in, as well as presentations of those projects:
Bioinformatics tools developed
This is where my tools are currently being developed.
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| SyNetBuilder Tool for reconstructing synthetic networks from assortativity data |
PDAC Modeling Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Cancer modeling with an agent-based model PhysiCell |
MOSNA GUI Graphical interface wrapping Tysserand and MOSNA to simplify their use |
AI Model Various IA models |
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| MORFEE Wrapper A Nextflow tools with MORFEE to analyse VCF larges datasets |
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Mosna GUI
A pour objectif de rendre l’utilisation du package MOSNA pour la détection de niches au sein de réseaux tissulaires biologiques plus ergonomique a l’aide d’une interface graphique. Celle-ci permet la modification des paramètres d’inputs de MOSNA ainsi que de Tysserand pour calculer à partir de données spatiales trancriptomiques/protéomiques des réseaux tissulaires et d’en extraire des données statistiques intrinsèques à ces mêmes réseaux.